论文Theflyingspider-monkeytreeferngenomeprovidesinsightsintofernevolutionandarborescencehttps://www.nature.com/articles/s41477-022-01146-6#Sec44数据下载链接https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19125641今天的推文重复一下论文中的ExtendedDataFig.3cimage.png他这个图的数据是怎么算出来的我还有点搞不明白,它的图注的内容也没有看明白Genepairsplottedaccordingtolog2f
论文Single-cellprofilingofvascularendothelialcellsrevealsprogressiveorgan-specificvulnerabilitiesduringobesityhttps://www.nature.com/articles/s42255-022-00674-x#Sec58s42255-022-00674-x.pdfhttps://github.com/Osynchronika/sc_EC_obesity_atlas大部分作图的数据都有,可以试着用论文中提供的数据复现一下论文中的图今天的推文我们复现一下论文中的figure4fimage.p
论文Pan-Africangenomedemonstrateshowpopulation-specificgenomegraphsimprovehigh-throughputsequencingdataanalysishttps://www.nature.com/articles/s41467-022-31724-3本地pdfs41467-022-31724-3.pdf论文中公布了大部分图的数据,但是没有公布对应的作图代码,没有关系,我们可以自己写代码试着模仿,今天的推文重复一下论文中的Figure2A带有条纹的分组柱形图示例数据截图image.png这里实现条纹柱形图用到的是ggpatter
论文PlasmaproteomeanalysesinindividualsofEuropeanandAfricanancestryidentifycis-pQTLsandmodelsforproteome-wideassociationstudieshttps://www.nature.com/articles/s41588-022-01051-w本地pdfs41588-022-01051-w.pdf代码链接https://zenodo.org/record/6332981#.YroV0nZBzichttps://github.com/Jingning-Zhang/PlasmaProtein/
论文Commonanti-cancertherapiesinducesomaticmutationsinstemcellsofhealthytissuehttps://www.nature.com/articles/s41467-022-33663-5#Sec18今天的推文我们重复一下论文中的Figure1a,看起来非常像一个表格,很有意思image.png我们使用ggplot2来实现,主要分为三个部分,文本,形状,和背景的灰色条首先是文本的部分数据截图image.png形状的三个数据截图image.png背景灰色条数据截图image.png总共5份数据,放在同一个excel文件里,5个不同的
论文Graphpangenomecapturesmissingheritabilityandempowerstomatobreedinghttps://www.nature.com/articles/s41586-022-04808-9#MOESM8没有找到论文里的作图的代码,但是找到了部分做图数据,我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图今天的推文重复一下论文中的Figure4bFigure4c箱线图叠加蜂群图Figure4b的部分数据截图image.png读取数据library(readxl)dat.fig4b作图代码(ggplot2)library(latex2exp)librar
论文Graphpangenomecapturesmissingheritabilityandempowerstomatobreedinghttps://www.nature.com/articles/s41586-022-04808-9#MOESM8s41586-022-04808-9.pdf没有找到论文里的作图的代码,但是找到了部分做图数据,我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图今天的推文重复一下论文中的ExtendedDataFig.4箱线图和堆积柱形图image.pngExtendedDataFig.4a的部分示例数据截图image.png读取数据并作图library(tidyv
论文PlasmaproteomeanalysesinindividualsofEuropeanandAfricanancestryidentifycis-pQTLsandmodelsforproteome-wideassociationstudieshttps://www.nature.com/articles/s41588-022-01051-w本地pdfs41588-022-01051-w.pdf代码链接https://zenodo.org/record/6332981#.YroV0nZBzichttps://github.com/Jingning-Zhang/PlasmaProtein/
论文Ahighlyconservedcorebacterialmicrobiotawithnitrogen-fixationcapacityinhabitsthexylemsapinmaizeplantshttps://www.nature.com/articles/s41467-022-31113-w本地pdfs41467-022-31113-w.pdf数据代码链接https://github.com/PlantNutrition/Liyu今天的推文我们来复现一下论文中的Figure2Bimage.png当然这个图用ppt很容易实现。用ggplot2来做会稍微繁琐一点,但是后续多图组合会方便
论文Alatitudinalgradientofdeep-seainvasionsformarinefisheshttps://www.nature.com/articles/s41467-023-36501-4s41467-023-36501-4.pdf论文中对应的图实现的代码都有,链接是https://github.com/stfriedman/Depth-transitions-paper今天的推文我们重复一下论文中的figure1A,其中一个堆积柱形图和一个哑铃图,哑铃图就是点和线段的组合首先是右侧哑铃图部分示例数据截图image.png有一些分组数据论文中没有提供,这部分数据我就随便