前面小编给大家介绍过☞KEGG富集分析—柱形图，气泡图，通路图☞【R语言】DAVIDKEGG富集分析结果可视化☞【R语言】circleplot展示KEGG富集分析结果☞R绘制KEGG富集弦图☞基因富集工具DAVID介绍（二）-KEGG富集分析☞基因富集工具DAVID介绍（三）-零代码展示KEGG富集结果也通过一系列视频给大家讲解过☞GO和KEGG富集分析视频讲解☞DAVID进行GO/KEGG富集分析及结果可视化最近小编在用R的clusterProfiler这个包进行KEGG富集分析的时候，遇到了下面这个错误最开始以为是网络问题，换了手机热点，还是报同样的错误。一怒之下，直接把这个包给删了，又通
前面粉丝反馈过，KEGG富集分析一直报错，得不到结果。小编第一时间跟大家分享了解决办法。☞KEGG富集分析一直报错，粉丝拯救了我！今天又有粉丝反馈KEGG报错小编尝试安装了最新版本的Rversion4.2.0(2022-04-22ucrt），然后用BiocManager安装了clusterProfiler包，显示版本为clusterProfiler_4.6.2BiocManager::install("clusterProfiler")然后试了一下自带的例子library(clusterProfiler)data(geneList,package='DOSE')de发现除了一些警告信息意外，是
往期回顾：在前面的课程中我们已经进行过“单样本数据分析”、“多样本数据整合”、“细胞类型注释”等内容的学习，相信大家现在已经能够对单细胞测序数据分析流程及Seurat对象的基本结构拥有了一定的了解。这一讲主要带领大家进行组间差异的计算及可视化方法的学习，这部分内容能够帮助科研工作者直接证明该数据集的前期试验设计，从前期枯燥的数据预处理走向文章中的Figure！视频教程：保姆级教程《手把手教你做单细胞测序数据分析》（六）——组间差异分析及可视化（B站同步播出，先看一遍视频再跟着代码一起操作，建议每个视频至少看三遍）代码：测试数据与第四讲多样本整合相同：读入并检查数据library(Seurat)
GO富集分析相信大家都不陌生，在很多的SCI文章里面都会看到。相信大家应该都见过像下面这样的气泡图或者柱形图。前面小编给大家系统的介绍了☞R进行GO和KEGG富集分析及结果可视化☞DAVID进行GO/KEGG富集分析及结果可视化也给大家讲解过☞展示DAVID富集分析结果中感兴趣的GO条目和KEGG通路还用视频给大家详细演示了☞如何挑选感兴趣的KEGG通路进行展示☞如何挑选感兴趣的GO条目进行展示最后我们带着大家用R语言来展示了挑选出的感兴趣的KEGG通路☞【R】气泡图和柱形图展示挑选的KEGG通路今天我们来用R语言通过上面提到的四种风格来展示挑选出的GO条目。GO富集分析结果跟KEGG富集分析
上次通过图文给大家讲解了如何从TCGA数据库下载体细胞突变的数据☞如何从TCGA数据库下载体细胞突变数据（somaticmutation）前面我们也讲过，如何从TCGA数据库下载RNAseq和miRNA-seq的数据。大家应该对TCGA数据库里面数据的格式有了一定的了解。☞新版TCGA数据库RNAseq数据下载☞新版TCGA数据库miRNA数据下载无论是RNAseq，miRNAseq还是体细胞突变的数据，都是单个的文件。也就是每一个样本会用一个单独的文件来存放相应的数据。如果我们想得到如下图所示的矩阵，就需要通过循环去读取每一个文件里面的内容，然后进行合并。前面已经跟大家分享过如何通过R代码或
为什么使用%2526而不是%26来编码&？我调用外部站点的URL，当我将&编码为%2526时，参数被正确传递，但是当我只使用%26他们不是。 最佳答案 如果您对&符号进行url编码，您将得到%26。如果您对%26进行url编码，您将获得%2526。因此，它被url编码了两次。 关于html-什么是url编码%2526？，我们在StackOverflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/9292865
circRNA故名思意，就是环状RNA的意思。是继miRNA，lncRNA之后的又一个后起之秀，备受关注。前面小编给大家介绍过☞circRNA的形成、功能、与癌症的关联☞【收藏】23个circRNA数据库网址☞circRNA研究综述+研究工具推荐☞ENCORI预测miRNA-circRNA调控关系☞处理ENCORI预测的miRNA-circRNA结果☞circRNA可翻译成蛋白质☞circRNA蛋白编码能力预测我在分析circRNA转录数据的时候经常会遇到一个很头疼的问题，就是circRNA的ID比较混乱，各个数据库中的ID无法对应。目前GEO里面的circRNA表达谱数据，绝大多数用的是Ar
circRNA故名思意，就是环状RNA的意思。是继miRNA，lncRNA之后的又一个后起之秀，备受关注。前面小编给大家介绍过☞circRNA的形成、功能、与癌症的关联☞【收藏】23个circRNA数据库网址☞circRNA研究综述+研究工具推荐☞ENCORI预测miRNA-circRNA调控关系☞处理ENCORI预测的miRNA-circRNA结果☞circRNA可翻译成蛋白质☞circRNA蛋白编码能力预测我在分析circRNA转录数据的时候经常会遇到一个很头疼的问题，就是circRNA的ID比较混乱，各个数据库中的ID无法对应。目前GEO里面的circRNA表达谱数据，绝大多数用的是Ar
前面给大家介绍了MAF文件格式☞MAF格式（mutationannotationformat）以及如何从TCGA数据库下载MAF格式的突变数据。☞如何从TCGA数据库下载体细胞突变数据（somaticmutation）今天我们来讲讲，怎么用R的maftools包来分析MAF格式的突变数据，并用瀑布图来展示结果。maftools这个包的主要分为两部分功能，分析和可视化。下图列出了，这个包中相应的函数的名字。我们先用maftools包自带的数据，给大家讲解这个包的使用方法。后面再来实战，重现SCI文章中的瀑布图。#安装maftools包BiocManager::install("maftools"
前面给大家介绍了MAF文件格式☞MAF格式（mutationannotationformat）以及如何从TCGA数据库下载MAF格式的突变数据。☞如何从TCGA数据库下载体细胞突变数据（somaticmutation）今天我们来讲讲，怎么用R的maftools包来分析MAF格式的突变数据，并用瀑布图来展示结果。maftools这个包的主要分为两部分功能，分析和可视化。下图列出了，这个包中相应的函数的名字。我们先用maftools包自带的数据，给大家讲解这个包的使用方法。后面再来实战，重现SCI文章中的瀑布图。#安装maftools包BiocManager::install("maftools"
