日常瞎掰 这一波疫情的反弹给上海很多地方按下了“暂停键”，从干饭人变成“饭人”，也许只有一个通告的距离。一觉醒来，也许小区大门口就贴上了“封闭管理的告示”。本以为就像告示说的那样，“封闭48小时，做两次核酸检测”，就完事了。可事情并原本预设的那样顺利，一轮核酸检测结束，接着第二轮检测，第二轮还没有结束，更糟糕的事情又来了，本来只是出不了小区，但不知啥时候冒出一个“密接”让我们出不了楼道的大门了。这一下活生生一个“饭人”样子了，连迈出屋门的自由都失去了。坚守在家的这些时间才体会到古人说的一句话，“生命诚可贵，爱情价更高，若为自由故，二者皆可抛”有了更深的认识，真的“自由”确实是可望而不及的！“
RNA-seq入门实战整体分析流程前言：进行RNA-seq入门实战首先需要有一定的linux与R基础，推荐跟着B站生信技能树-jimmy老师学习打牢基础：【生信技能树】生信人应该这样学linux(更新至第14集)_哔哩哔哩_bilibili【生信技能树】生信人应该这样学R语言_哔哩哔哩_bilibili本节概览：Linux下RNA-seq环境创建:Ubuntu子系统下载安装、Mniconda3与上游分析软件下载R下RNA-seq环境创建R与Rstudio下载安装、Bioconductor与R包下载1.Linux环境设置1.1Linux系统的创建——Ubuntu运行Linux系统一般使用服务器或
scATAC-seq：scATAC-seq（Single-cellAssayforTransposase-AccessibleChromatinusingsequencing）是一种单细胞基因组学技术，它可以用来鉴定每个单细胞的开放染色质区域（AccessibleChromatin）。它结合了两个技术：Transposase-AccessibleChromatinsequencing（ATAC-seq）和单细胞测序。ATAC-seq技术使用的是一种叫做Transposase的酶，该酶可以识别并切断开放的染色质区域。通过添加一些测序适配器，这些开放的区域就可以被扩增、测序和定位到基因组上。使用A
要实战之前，要有数据和软件两样。一、数据从网上下载数据，最好的办法是本节最后的方法直接用sratoolkit里的fastq-dump命令。下面的是学习过程，但是走弯路了，——按照day18更新版本操作更简便，而且直接能转换成样本名称1.jimmy大神早前的帖子里用了ChIP-seq实战和视频里不一样。2.从GEO下载数据可以详见手把手教你如何从GEO下载数据。方法一：从网页下，需要在NCBI的GEO数据库中进入相应的GEOSeries(GSE)studyID，如GSE42466。再选择要下载的样本GEOSample(GSM)样本ID，如GSM1041372Ring1B_ChIPSeq。再点击R
好的，所以我有这个作业问题，我知道“主机X”向“主机Z”发送了一个数据包，Seq=46和Ack=87，有效负载/数据=“你好？”从那里我得到:一个从主机Z发送到主机X的数据包，有效负载='Goaway'，最后一个数据包从主机X发送到主机Z，数据='No!'作业是找出最后两个数据包的Seq和Ack的值。我知道握手已经结束，所以它不仅仅是将Seq加1并将其放入下一个数据包的Ack中那么简单。我在某处读到，当接收到有效载荷时，接收者会发出一个等于1+有效载荷字节长度的Ack。如果那是正确的，我将如何将这些字符串转换为字节？Seq会发生什么？这仍然是直接从先前的数据包Ack中抓取的吗？非常感谢
既然TCPheader是一个比较大的开销，为什么不采用ACK和SEQ共享同一个字段的方式进行压缩，仍然可以通过header中的flags来区分呢？ 最佳答案 因为它们不是专门使用的。下面是最重要的:连接协商，即三次握手:(来源:wikimedia.org)图片来自维基共享资源。它介绍了TCP连接是如何协商的，并显示了ACK和SEQ在同一个标头中一起使用以建立连接(我写这个是为了确保答案对您有所帮助，即使有一天图片会消失)。 关于networking-为什么TCP头中同时包含ACK和S
本文介绍的用法相对复杂,简单的用法请参考这篇文章seq_file适用于内核需要向应用层输出信息时使用，最常见的用法是遍历内核中的一个list数据结构输出list的内容到应用层；当然也可以输出任意的数据，并且输出到应用层的数据大小没有限制，默认缓冲区是一个PAGE_SIZE，当输出的数据大于PAGE_SIZE时seq_file会把缓冲区大小翻倍，直到超过要输出的数据大小，或者把内存耗尽。seq_file不能单独使用，需要配合procfs或者sysfs等文件系统使用，利用文件系统提供的file_operations接口和应用层交互；seq_file本身也无法接收来自应用层的数据，同样需要使用fil
前面一个帖子讲了scissor的原理以及paper中的一些应用实例。几天我们来测试这个工具。========安装========devtools::install_github('sunduanchen/Scissor')devtools::install_github("jinworks/scAB")注：因为我们还要用到scAB工具中的例子，所以顺便安装一下。library(Scissor)library(Seurat)library(preprocessCore)library(scAB)=======加载数据======data("data_survival")dim(sc_datase
1：为什么merge的时候，明明一个数据集是每人一条，然后另一个数据集是一人多条的时候，通过usubjid连接的时候，还是只有一个人只有一条记录。也就是说我现在要将RFPENDTC merge 到其他数据集的时候，即使这个数据集是一人一条，但是最终输出的也只是一个人只有一个RFPENDTC的记录，而不是这个人的每条观测都有RFPENDTC.就比如说data dm;set sdtm.dm;RFXSTDTC=substr(RFXSTDTC,1,10);keep USUBJIDRFICDTCRFXSTDTCRFPENDTCARMCDDTHDTC;procsort;byUSUBJID;run;data
HIVE不同时区时间的转换前言日常开发中经常需要对不同时区的时间或时间戳进行转换。以下假定我们HIVE所使用的的默认时区是PST时区，思路是不管传入的什么时区都先转成UTC时区PRC/CST=PST(PDT)+15h(夏)=UTC/GMT+8hPRC/CST=PST(PDT)+16h(冬)=UTC/GMT+8h一、正文1.current_timestamp()selectcurrent_timestamp;结果：这里拿到的是PST时区的时间2.to_utc_timestamp()selectto_utc_timestamp(current_timestamp,'PST');结果：2.from_
