目录生信工作流框架搭建|04-nextflow与Slurm高性能计算前情提要什么是HPC高性能计算什么是slurmnextflow配置注意事项下期预告生信工作流框架搭建|04-nextflow与Slurm高性能计算本篇为biodoge《生信工作流框架搭建》系列笔记的第5篇，该系列将持续更新。前情提要上回生信工作流框架搭建|03-nextflow与AWS批量计算为大家提供了nextflow上云的实用教程。虽然AWS批量计算技术含量较大，但毕竟在国内应用场景较少，下面将为大家介绍另一种更为常用的应用：阿里云的HPC高性能计算。本身slurm＋nextflow操作非常简单，但是鉴于网络资料较少，且有

流程化！个人感觉是生信最头疼的问题之一，当你东平西凑整出一台符合自己分析目的的流程时，会发现在处理过程中，仍需要人工对接每一步的输入输出，特别是对于流程复杂，而又经常使用的情况，这是一笔不小的人工消耗；既然如此，那就将这些流程统统写进代码里，下次使用时，直接调用！流程化的软件很多，我调研过的就三种：Shell脚本：最简单的流程化方式，在脚本内你可以指定待输入的参数，但最大的问题就是无法缓存中间文件，这意味着如果那一天你的脚本报错，你只能自己去排错，然后又重新跑。snakemake：这应该是网上教程最多的流程化软件，基于Python框架，对于初学者和python爱好者会比较易懂，相比于单纯she

流程化！个人感觉是生信最头疼的问题之一，当你东平西凑整出一台符合自己分析目的的流程时，会发现在处理过程中，仍需要人工对接每一步的输入输出，特别是对于流程复杂，而又经常使用的情况，这是一笔不小的人工消耗；既然如此，那就将这些流程统统写进代码里，下次使用时，直接调用！流程化的软件很多，我调研过的就三种：Shell脚本：最简单的流程化方式，在脚本内你可以指定待输入的参数，但最大的问题就是无法缓存中间文件，这意味着如果那一天你的脚本报错，你只能自己去排错，然后又重新跑。snakemake：这应该是网上教程最多的流程化软件，基于Python框架，对于初学者和python爱好者会比较易懂，相比于单纯she