这将是一个很长的故事,但也许你们中的一些人愿意研究这个案例。我正在从事并行图算法开发。我选择了一个名为STINGER的尖端HPC并行图数据结构。.STINGER的使命声明如下:"STINGERshouldprovideacommonabstractdatastructuresuchthatthelargegraphcommunitycanquicklyleverageeachothers'researchdevelopments.[...] AlgorithmswrittenforSTINGERcaneasilybetranslated/portedbetweenmultiplelan
我正在做一堆MPI_Iallreduce非阻塞通信。我已将这些Iallreduce调用添加到我的代码中的几个不同位置。每隔一段时间,我想暂停并等待所有Iallreduce调用完成。具有MPI_Request簿记功能的版本1——有效:MPI_Requestrequests[];MPI_Iallreduce(...,requests[0]);...MPI_Iallreduce(...,requests[n-1]);for(inti=0;i但是,我在一个相当大的代码库中工作,我不想编写额外的代码来跟踪所有这些MPI_Request对象。我想执行以下操作:版本2没有MPI_Request簿记—
我刚刚开始从事一个速度非常重要的科学项目(HPC)。我目前正在设计数据结构。该项目的核心是双值的3D网格,用于求解偏微分方程。由于这里的速度可能比代码的简单性更受关注,我想知道与通常的C样式数组相比,STL的性能如何。在我的例子中,因为它是一个3D网格,我正在考虑a)一个具有线性索引的一维vectorb)一个包含3个vector的vector或c)一维c型数组或d)一个三维c型数组。我查找了较早的问题,但我只发现了有关构造/破坏的问题(这在这里并不重要,因为数据结构仅在程序启动时创建一次-快速索引和计算很重要)或不同STL的比较容器。感谢帮助 最佳答案
我正在尝试使用MPI发送和接收函数发送std:vector但我没有到达任何地方。我收到类似的错误FatalerrorinMPI_Recv:Invalidbufferpointer,errorstack:MPI_Recv(186):MPI_Recv(buf=(nil),count=2,MPI_INT,src=0,tag=0,MPI_COMM_WORLD,status=0x7fff9e5e0c80)failedMPI_Recv(124):Nullbufferpointer我尝试了多种组合A)就像用来发送数组的..std::vectorm_image_data2;//definitionof
所以我有一些使用dlopen加载库的代码,我希望它在bluegene系统上工作,但我没有bluegene来测试东西,我已经从未直接与任何人合作过。bluegene是支持ltdl.h,还是用别的东西?如果是,它有什么用? 最佳答案 BlueGene/L不支持库的动态链接或加载。这在redbook中有解释。在第5章中。AlthoughBlueGene/LusestheIBMXLcompilers,therearedifferenceswithrespecttoallotherIBMservers.Inparticular,intheca
我已经从http://www.bsc.es/computer-sciences/grid-computing/comp-superscalar/downloads-and-documentation下载了COMPSs1.4和一些测试程序。我正在尝试测试它们。Java执行很顺利;但是,我在使用C时遇到了问题。我目前正在尝试执行Simple.自述文件指出我只需要两个命令:buidappsimpleruncompss--lang=cmaster/simple1应用程序构建正常,但是当使用此命令执行时,出现以下错误:[ERRMGR]-WARNING:Job1forrunningtask1onw
『HPC运维点滴』第01期UbuntuServer20.04集群网络配置第一步:烧录镜像1.下载镜像2.使用烧录工具第二步:安装过程第三步:网络配置第四步:跳板机登陆与本地代理闲杂与安利时间UbuntuServer20.04集群网络配置第一步:烧录镜像1.下载镜像前往开源软件镜像站下载UbuntuServer20.04镜像,以下地址选择一种:中国科学技术大学开源软件镜像站下载地址北京外国语大学软件镜像站下载地址清华大学软件镜像站下载地址2.使用烧录工具推荐使用BalenaEtcher工具,点击前往官网。下载安装后打开此软件:点击Flashfromfile,选择下载的镜像。点击Selecttar
普通用户权限超算集群安装OpenFOAM-LIGGGHTS-CFDEM,由于缺少root权限,无法根据CFDEM官方instruction进行安装。本文以CSU超算平台为例,利用普通用户权限进行编译安装。文章修正了已有教程中部分问题,特别感谢希望先生与记得小蘋初见教程。1.安装必要依赖包此部分在记得小蘋初见中已有详细介绍,不再赘述。需要说明的是,普通用户权限只能自行在网上搜索rpmpackage(二进制)并使用rpm-ivh命令来安装。(经测试,CSUHPC平台已具备所有必须依赖,无需自行安装)2.安装openmpi安装openmpi为必要环节。此处笔者曾尝试按照希望先生方法调用平台/publ
我正在为一些数据处理开发一个松散耦合的集群。网络代码和处理代码已经到位,但我们正在评估我们方法中的不同方法。现在,正如我们应该做的那样,我们在性能问题上受到I/O的限制,我们正在努力减少这个瓶颈。显然,像Infiniband这样更快的交换机会很棒,但我们无法承受仅仅扔掉现有设备并购买新设备的奢侈。我提出的问题是这样的。在集群上完成的所有传统和重要的HPC应用程序通常都是通过消息传递而不是直接通过套接字发送来实现的。这有什么性能优势?如果我们从套接字切换,我们应该看到加速吗? 最佳答案 MPI可能会使用套接字。但是也有MPI实现与使用
我正在尝试将我的应用程序移植到64位Python。在我的64位Windows7工作站(配备E8600Core2Duo)上一切正常,但是当我尝试在WindowsServer2008上执行相同的Python2.7.264位程序(存储在网络位置)时带有XeonX5680的HPC系统,它立即失败(无论是否传递源文件)并显示一个对话框:“应用程序无法正确启动(0xc00000cc)。单击确定关闭应用程序。”我认为这两种处理器都应该支持x86-64指令集,所以我很惊讶它不能“正常工作”。LookinguptheerrorcodefromMicrosoft,我发现它的意思是“{NetworkName