LEfSe(LineardiscriminantanalysisEffectSize)是一种用于发现和解释高维度数据生物标识（基因、通路和分类单元等）的分析工具，可以进行两个或多个分组的比较，它强调统计意义和生物相关性，能够在组与组之间寻找具有统计学差异的生物标识（Biomarker）。1.在线安装Galaxy中可以使用admin账号在ToolShed中直接搜索lefse，并根据提示一步一步进行安装。本文章的所有截图与操作均来自于zGalaxy，一个基于Galaxyrelease_17.09，部署在阿里云ECS经过深度定制的中文版生物信息分析测试平台。安装完成的网页界面：2.模块依赖LEfSe

LEfSe(LineardiscriminantanalysisEffectSize)是一种用于发现和解释高维度数据生物标识（基因、通路和分类单元等）的分析工具，可以进行两个或多个分组的比较，它强调统计意义和生物相关性，能够在组与组之间寻找具有统计学差异的生物标识（Biomarker）。1.在线安装Galaxy中可以使用admin账号在ToolShed中直接搜索lefse，并根据提示一步一步进行安装。本文章的所有截图与操作均来自于zGalaxy，一个基于Galaxyrelease_17.09，部署在阿里云ECS经过深度定制的中文版生物信息分析测试平台。安装完成的网页界面：2.模块依赖LEfSe

1. 背景介绍LEfse分析即LDAEffectSize分析，可以实现多个分组之间的比较，还进行分组比较的内部进行亚组比较分析，从而找到组间在丰度上有显著差异的物种（即biomaker），主要是通过非参数因子Kruskal-Wallis秩和检验来实现的。LEfSe2.0在线工具在1.0工具基础上，增加了LDA判别分析结果文件（仅含差异显著）。增加差异特征图，以及所有结果图的重绘功能。工具链接：http://www.cloud.biomicroclass.com/CloudPlatform/SoftPage/LF22. 操作方法操作界面lefse分析需要输入的文件包含OTU丰度表和分组文件，OT

1. 背景介绍LEfse分析即LDAEffectSize分析，可以实现多个分组之间的比较，还进行分组比较的内部进行亚组比较分析，从而找到组间在丰度上有显著差异的物种（即biomaker），主要是通过非参数因子Kruskal-Wallis秩和检验来实现的。LEfSe2.0在线工具在1.0工具基础上，增加了LDA判别分析结果文件（仅含差异显著）。增加差异特征图，以及所有结果图的重绘功能。工具链接：http://www.cloud.biomicroclass.com/CloudPlatform/SoftPage/LF22. 操作方法操作界面lefse分析需要输入的文件包含OTU丰度表和分组文件，OT