我正在尝试处理来自非常大的 netCDF 文件(每个约 400 Gb)的数据。每个文件都有一些变量，都比系统内存大得多(例如 180 Gb 与 32 Gb RAM)。我正在尝试使用 numpy 和 netCDF4-python 通过一次复制一个切片并对该切片进行操作来对这些变量执行一些操作。不幸的是，读取每个切片需要很长时间，这会降低性能。
例如，其中一个变量是形状为 (500, 500, 450, 300) 的数组。我想对切片 [:,:,0] 进行操作，所以我执行以下操作:
import netCDF4 as nc
f = nc.Dataset('myfile.ncdf','r+')
myvar = f.variables['myvar']
myslice = myvar[:,:,0]
但最后一步需要很长时间(在我的系统上大约 5 分钟)。例如，如果我在 netcdf 文件中保存了一个形状为 (500, 500, 300) 的变量，那么读取相同大小的操作只需几秒钟。
有什么办法可以加快速度吗？一个明显的路径是转置数组，以便我选择的索引首先出现。但是在这么大的文件中，这不可能在内存中完成，而且考虑到一个简单的操作已经需要很长时间，尝试它似乎更慢。我想要的是一种以 Fortran 接口(interface) get_vara 函数的方式快速读取 netcdf 文件片段的方法。或者一些有效转置数组的方法。
最佳答案
您可以使用 nccopy 实用程序转置太大而无法放入内存的 netCDF 变量，此处记录了该实用程序:
http://www.unidata.ucar.edu/netcdf/docs/guide_nccopy.html
想法是通过指定 block 的形状(多维图 block )来“重新分 block ”文件 你想要的变量。您可以指定将多少内存用作缓冲区以及将多少内存用作缓冲区 用于 block 缓存，但不清楚如何在这些用途之间最佳地使用内存，所以你 可能只需要尝试一些示例并为它们计时。而不是完全转置一个变量， 您可能希望通过指定包含大量数据的 block 来“部分转置”它 切片的 2 个大维度，其他维度只有几个值。
关于python - 在 python 中处理非常大的 netCDF 文件，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/12067876/
我有一个Ruby程序，它使用rubyzip压缩XML文件的目录树。gem。我的问题是文件开始变得很重，我想提高压缩级别，因为压缩时间不是问题。我在rubyzipdocumentation中找不到一种为创建的ZIP文件指定压缩级别的方法。有人知道如何更改此设置吗？是否有另一个允许指定压缩级别的Ruby库？ 最佳答案 这是我通过查看rubyzip内部创建的代码。level=Zlib::BEST_COMPRESSIONZip::ZipOutputStream.open(zip_file)do|zip|Dir.glob("**/*")d
我试图在一个项目中使用rake，如果我把所有东西都放到Rakefile中，它会很大并且很难读取/找到东西，所以我试着将每个命名空间放在lib/rake中它自己的文件中，我添加了这个到我的rake文件的顶部:Dir['#{File.dirname(__FILE__)}/lib/rake/*.rake'].map{|f|requiref}它加载文件没问题，但没有任务。我现在只有一个.rake文件作为测试，名为“servers.rake”，它看起来像这样:namespace:serverdotask:testdoputs"test"endend所以当我运行rakeserver:testid时
我的目标是转换表单输入，例如“100兆字节”或“1GB”，并将其转换为我可以存储在数据库中的文件大小(以千字节为单位)。目前，我有这个:defquota_convert@regex=/([0-9]+)(.*)s/@sizes=%w{kilobytemegabytegigabyte}m=self.quota.match(@regex)if@sizes.include?m[2]eval("self.quota=#{m[1]}.#{m[2]}")endend这有效，但前提是输入是倍数(“gigabytes”，而不是“gigabyte”)并且由于使用了eval看起来疯狂不安全。所以，功能正常，
关闭。这个问题是opinion-based.它目前不接受答案。想要改进这个问题？更新问题，以便editingthispost可以用事实和引用来回答它.关闭4年前。Improvethisquestion我想在固定时间创建一系列低音和高音调的哔哔声。例如:在150毫秒时发出高音调的蜂鸣声在151毫秒时发出低音调的蜂鸣声200毫秒时发出低音调的蜂鸣声250毫秒的高音调蜂鸣声有没有办法在Ruby或Python中做到这一点？我真的不在乎输出编码是什么(.wav、.mp3、.ogg等等)，但我确实想创建一个输出文件。
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我正在寻找执行以下操作的正确语法(在Perl、Shell或Ruby中):#variabletoaccessthedatalinesappendedasafileEND_OF_SCRIPT_MARKERrawdatastartshereanditcontinues. 最佳答案 Perl用__DATA__做这个:#!/usr/bin/perlusestrict;usewarnings;while(){print;}__DATA__Texttoprintgoeshere 关于ruby-如何将脚
Rackup通过Rack的默认处理程序成功运行任何Rack应用程序。例如:classRackAppdefcall(environment)['200',{'Content-Type'=>'text/html'},["Helloworld"]]endendrunRackApp.new但是当最后一行更改为使用Rack的内置CGI处理程序时，rackup给出“NoMethodErrorat/undefinedmethod`call'fornil:NilClass”:Rack::Handler::CGI.runRackApp.newRack的其他内置处理程序也提出了同样的反对意见。例如Rack
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好的，所以我的目标是轻松地将一些数据保存到磁盘以备后用。您如何简单地写入然后读取一个对象？所以如果我有一个简单的类classCattr_accessor:a,:bdefinitialize(a,b)@a,@b=a,bendend所以如果我从中非常快地制作一个objobj=C.new("foo","bar")#justgaveitsomerandomvalues然后我可以把它变成一个kindaidstring=obj.to_s#whichreturns""我终于可以将此字符串打印到文件或其他内容中。我的问题是，我该如何再次将这个id变回一个对象？我知道我可以自己挑选信息并制作一个接受该信