jjzjj

xml - 将xml "rows"加载到R数据表中

coder 2024-06-26 原文

我有一些这样的数据:

<people>
  <person first="Mary" last="Jane" sex="F" />
  <person first="Susan" last="Smith" sex="F" height="168" />
  <person last="Black" first="Joseph" sex="M" />
  <person first="Jessica" last="Jones" sex="F" />
</people>

我想要一个如下所示的数据框:

    first  last sex height
1    Mary  Jane   F     NA
2   Susan Smith   F    168
3  Joseph Black   M     NA
4 Jessica Jones   F     NA

我已经走到这一步了:

library(XML)
xpeople <- xmlRoot(xmlParse(xml))
lst <- xmlApply(xpeople, xmlAttrs)
names(lst) <- 1:length(lst)

但我终究无法弄清楚如何将列表放入数据框中。我可以让列表成为“正方形”(即填补空白)，然后将其放入数据框中:

lst <- xmlApply(xpeople, function(node) {
  attrs = xmlAttrs(node)
  if (!("height" %in% names(attrs))) {
    attrs[["height"]] <- NA
  }
  attrs
})
df = as.data.frame(lst)

但是我有以下问题:

  1. 数据框被转置
  2. first 和 last 是因子，不是 chr
  3. 高度是一个因素，不是数字
  4. Joseph Black 的名字和姓氏被调换了(这不是什么大问题，因为我的数据通常是一致的，但仍然很烦人)

如何获得正确形式的数据框？

最佳答案 

txt <- '<people>
          <person first="Mary" last="Jane" sex="F" />
          <person first="Susan" last="Smith" sex="F" height="168" />
          <person last="Black" first="Joseph" sex="M" />
          <person first="Jessica" last="Jones" sex="F" />
        </people>'
library(XML)         # for xmlTreeParse
library(data.table)  # for rbindlist(...)
xml <- xmlTreeParse(txt, asText=TRUE, useInternalNodes = TRUE)
rbindlist(lapply(xml["//person"],function(x)as.list(xmlAttrs(x))),fill=TRUE)
#      first  last sex height
# 1:    Mary  Jane   F     NA
# 2:   Susan Smith   F    168
# 3:  Joseph Black   M     NA
# 4: Jessica Jones   F     NA

你需要 as.list(xmlAttrs(...)) 而不仅仅是 xmlAttrs(...) 因为 rbindlist(...) 希望每个参数都是一个列表，而不是一个向量。

关于xml - 将xml "rows"加载到R数据表中，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/32869100/

xmlamp34codefirstrdataframe

有关xml - 将xml "rows"加载到R数据表中的更多相关文章

  1. ruby-on-rails - rails : "missing partial" when calling 'render' in RSpec test - 2

    我正在尝试测试是否存在表单。我是Rails新手。我的new.html.erb_spec.rb文件的内容是:require'spec_helper'describe"messages/new.html.erb"doit"shouldrendertheform"dorender'/messages/new.html.erb'reponse.shouldhave_form_putting_to(@message)with_submit_buttonendendView本身，new.html.erb，有代码:当我运行rspec时，它失败了:1)messages/new.html.erbshou

  2. ruby-on-rails - 由于 "wkhtmltopdf"，PDFKIT 显然无法正常工作 - 2

    我在从html页面生成PDF时遇到问题。我正在使用PDFkit。在安装它的过程中，我注意到我需要wkhtmltopdf。所以我也安装了它。我做了PDFkit的文档所说的一切......现在我在尝试加载PDF时遇到了这个错误。这里是错误:commandfailed:"/usr/local/bin/wkhtmltopdf""--margin-right""0.75in""--page-size""Letter""--margin-top""0.75in""--margin-bottom""0.75in""--encoding""UTF-8""--margin-left""0.75in""-

  3. ruby - 解析 RDFa、微数据等的最佳方式是什么，使用统一的模式/词汇(例如 schema.org)存储和显示信息 - 2

    我主要使用Ruby来执行此操作，但到目前为止我的攻击计划如下:使用gemsrdf、rdf-rdfa和rdf-microdata或mida来解析给定任何URI的数据。我认为最好映射到像schema.org这样的统一模式，例如使用这个yaml文件，它试图描述数据词汇表和opengraph到schema.org之间的转换:#SchemaXtoschema.orgconversion#data-vocabularyDV:name:namestreet-address:streetAddressregion:addressRegionlocality:addressLocalityphoto:i

  4. ruby-on-rails - 如何从 format.xml 中删除 <hash></hash> - 2

    我有一个对象has_many应呈现为xml的子对象。这不是问题。我的问题是我创建了一个Hash包含此数据，就像解析器需要它一样。但是rails自动将整个文件包含在.........我需要摆脱type="array"和我该如何处理？我没有在文档中找到任何内容。 最佳答案 我遇到了同样的问题；这是我的XML:我在用这个:entries.to_xml将散列数据转换为XML，但这会将条目的数据包装到中所以我修改了:entries.to_xml(root:"Contacts")但这仍然将转换后的XML包装在“联系人”中，将我的XML代码修改为

  5. ruby - 检查 "command"的输出应该包含 NilClass 的意外崩溃 - 2

    为了将Cucumber用于命令行脚本，我按照提供的说明安装了arubagem。它在我的Gemfile中，我可以验证是否安装了正确的版本并且我已经包含了require'aruba/cucumber'在'features/env.rb'中为了确保它能正常工作，我写了以下场景:@announceScenario:Testingcucumber/arubaGivenablankslateThentheoutputfrom"ls-la"shouldcontain"drw"假设事情应该失败。它确实失败了，但失败的原因是错误的:@announceScenario:Testingcucumber/ar

  6. ruby - 如何在续集中重新加载表模式？ - 2

    鉴于我有以下迁移:Sequel.migrationdoupdoalter_table:usersdoadd_column:is_admin,:default=>falseend#SequelrunsaDESCRIBEtablestatement,whenthemodelisloaded.#Atthispoint,itdoesnotknowthatusershaveais_adminflag.#Soitfails.@user=User.find(:email=>"admin@fancy-startup.example")@user.is_admin=true@user.save!ende

  7. ruby-on-rails - 迷你测试错误 : "NameError: uninitialized constant" - 2

    我遵循MichaelHartl的“RubyonRails教程:学习Web开发”，并创建了检查用户名和电子邮件长度有效性的测试(名称最多50个字符，电子邮件最多255个字符)。test/helpers/application_helper_test.rb的内容是:require'test_helper'classApplicationHelperTest在运行bundleexecraketest时，所有测试都通过了，但我看到以下消息在最后被标记为错误:ERROR["test_full_title_helper",ApplicationHelperTest,1.820016791]test

  8. ruby - RuntimeError(自动加载常量 Apps 多线程时检测到循环依赖 - 2

    我收到这个错误:RuntimeError(自动加载常量Apps时检测到循环依赖当我使用多线程时。下面是我的代码。为什么会这样？我尝试多线程的原因是因为我正在编写一个HTML抓取应用程序。对Nokogiri::HTML(open())的调用是一个同步阻塞调用，需要1秒才能返回，我有100,000多个页面要访问，所以我试图运行多个线程来解决这个问题。有更好的方法吗？classToolsController0)app.website=array.join(',')putsapp.websiteelseapp.website="NONE"endapp.saveapps=Apps.order("

  9. ruby-on-rails - 相关表上的范围为 "WHERE ... LIKE" - 2

    我正在尝试从Postgresql表(table1)中获取数据，该表由另一个相关表(property)的字段(table2)过滤。在纯SQL中，我会这样编写查询:SELECT*FROMtable1JOINtable2USING(table2_id)WHEREtable2.propertyLIKE'query%'这工作正常:scope:my_scope,->(query){includes(:table2).where("table2.property":query)}但我真正需要的是使用LIKE运算符进行过滤，而不是严格相等。然而，这是行不通的:scope:my_scope,->(que

  10. 使用 ACL 调用 upload_file 时出现 Ruby S3 "Access Denied"错误 - 2

    我正在尝试编写一个将文件上传到AWS并公开该文件的Ruby脚本。我做了以下事情:s3=Aws::S3::Resource.new(credentials:Aws::Credentials.new(KEY,SECRET),region:'us-west-2')obj=s3.bucket('stg-db').object('key')obj.upload_file(filename)这似乎工作正常，除了该文件不是公开可用的，而且我无法获得它的公共(public)URL。但是当我登录到S3时，我可以正常查看我的文件。为了使其公开可用，我将最后一行更改为obj.upload_file(file

随机推荐