我正在用 C++ 编写一个使用 MPI 的程序。我的代码的简化版本是
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <cstdlib>
#include <mpi.h>
#define RNumber 3000000 //Number of loops to go
using namespace std;
class LObject {
/*Something here*/
public:
void FillArray(long * RawT){
/*Does something*/
for (int i = 0; i < RNumber; i++){
RawT[i] = i;
}
}
};
int main() {
int my_rank;
int comm_sz;
MPI_Init(NULL, NULL);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &my_rank);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &comm_sz);
LObject System;
long rawT[RNumber];
long * Times = NULL;
if (my_rank == 0) Times = (long*) malloc(comm_sz*RNumber*sizeof(long));
System.FillArray(rawT);
if (my_rank == 0) {
MPI_Gather(rawT, RNumber, MPI_LONG, Times, RNumber,
MPI_LONG, 0, MPI_COMM_WORLD);
}
else {
MPI_Gather(rawT, RNumber, MPI_LONG, Times, RNumber,
MPI_LONG, 0, MPI_COMM_WORLD);
}
MPI_Finalize();
return 0;
};
程序编译正常,但在执行时给出了段错误。消息是
=================================================================================
= BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES
= EXIT CODE: 11
= CLEANING UP REMAINING PROCESSES
= YOU CAN IGNORE THE BELOW CLEANUP MESSAGES
=================================================================================
APPLICATION TERMINATED WITH THE EXIT STRING: Segmentation fault (signal 11)
当我减少 RNumber 时,程序工作正常。也许有人可以解释到底出了什么问题?我是否试图为数组分配太多空间?如果是这样的话,这个问题是否可以通过将结果存储在文件而不是数组中来解决?
如果可能的话,请您对我做错的事情给出广泛的评论。
感谢您付出的时间和精力!
最佳答案
几个可能的问题:
long rawT[RNumber];
要放入堆栈的数组相当大。堆栈大小通常有限制(尤其是在多线程程序中),典型大小为一或两兆字节。 std::vector<long> 你会过得更好在这里。
Times = (long*) malloc(comm_sz*RNumber*sizeof(long));
您应该检查内存分配是否成功。或者更好,使用 std::vector<long>这里也一样(这也将修复您的内存泄漏)。
if (my_rank == 0) {
// do stuff
} else {
// do exactly the same stuff
}
我猜 else block 应该做一些不同的事情;特别是,不涉及 Times 的东西,因为除非 my_rank == 0 否则它为 null .
更新:要使用 vector 而不是原始数组,只需将其初始化为您想要的大小,然后使用指向您将使用(指向)数组的第一个元素的指针:
std::vector<long> rawT(RNumber);
System.FillArray(&rawT[0]);
std::vector<long> Times(comm_sz*RNumber);
MPI_Gather(&rawT[0], RNumber, MPI_LONG, &Times[0], RNumber,
MPI_LONG, 0, MPI_COMM_WORLD);
请注意,如果您调整 vector 的大小,指针将失效(尽管如果您只是将其用作数组的替代品,则不需要这样做)。
关于c++ - MPI程序的段错误,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/8047575/
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