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docker - Dockerfile中的Wget,文件在容器中消失

coder 2023-05-28 原文

在 Docker 文件中,我使用 wget 下载图像中的文件。但是当我在 docker-compose 文件中使用这个图像时,容器不包含这些文件......

    FROM debian:8

    RUN apt-get update && apt-get install -y wget && rm -rf /var/lib/apt/lists/*

    RUN mkdir -p /blast  && cd /blast
    RUN wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz
    RUN tar zxvpf ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz && rm ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz
    RUN export PATH=$PATH:/blast/ncbi-blast-2.6.0+/bin
    #&& export BLASTDB=/blast/blastdb

    CMD ["sleep", "infinity"]

在容器中,我有/blast 文件夹,但没有文件...有人知道我可以如何执行 wget 并保留文件吗?为什么它们会消失?

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docker 历史

    IMAGE               CREATED             CREATED BY                                      SIZE                COMMENT
    13361cc1dda8        9 minutes ago       /bin/sh -c #(nop)  CMD ["sleep" "infinity"]     0 B                 
    748afb9b0a0a        9 minutes ago       /bin/sh -c #(nop) WORKDIR /blast                0 B                 
    6eb2b58af7d4        9 minutes ago       /bin/sh -c export PATH=$PATH:/blast/ncbi-b...   0 B                 
    1331a22dcf67        10 minutes ago      /bin/sh -c wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov...   675 MB              
    83d2844843e5        35 minutes ago      /bin/sh -c mkdir -p /blast  && cd /blast        0 B                 
    6b0b6a13ae47        41 minutes ago      /bin/sh -c apt-get update && apt-get insta...   41.2 MB             
    054abe38b1e6        12 hours ago        /bin/sh -c #(nop)  CMD ["/bin/bash"]            0 B                 
    <missing>           12 hours ago        /bin/sh -c #(nop) ADD file:712c48086043553...   123 MB         

docker-compose build 的输出(提取部分)

    2017-04-25 07:41:47 (10.1 MB/s) - 'ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz' saved [222504398]

    ncbi-blast-2.6.0+/
    ncbi-blast-2.6.0+/ChangeLog
    ncbi-blast-2.6.0+/LICENSE
    ncbi-blast-2.6.0+/ncbi_package_info
    ncbi-blast-2.6.0+/doc/
    ncbi-blast-2.6.0+/doc/README.txt
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/makeblastdb
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/tblastx
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/tblastn
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/blastn
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/blastdb_aliastool
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/update_blastdb.pl
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/windowmasker
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/psiblast
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/blastx
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/rpsblast
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/segmasker
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/blastdbcheck
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/rpstblastn
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/deltablast
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/makembindex
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/convert2blastmask
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/blastp
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/dustmasker
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/makeprofiledb
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/blastdbcmd
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/legacy_blast.pl
    ncbi-blast-2.6.0+/bin/blast_formatter
    ncbi-blast-2.6.0+/README
     ---> 1331a22dcf67
    Removing intermediate container 06070bb79e70

最佳答案

将你的 RUN 分组,在一个 RUN 中执行 wget 和 tar,类似

运行 wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz\ && tar zxvpf ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz && rm ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz

查看编写 Dockerfile 的最佳实践

https://docs.docker.com/engine/userguide/eng-image/dockerfile_best-practices/

在你的 Dockerfile 中使用 ENV 而不是导出

https://docs.docker.com/engine/reference/builder/#env

关于docker - Dockerfile中的Wget,文件在容器中消失,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/43604130/

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