jjzjj

python - 将(所有)维基百科数据加载到 mongodb 中?

coder 2023-10-31 原文

在 MongoNYC 2013 session 上,一位演讲者提到他们使用维基百科的副本来测试他们的全文搜索。我试图自己复制它,但由于文件大小和格式的原因,我发现它很重要。

这是我正在做的:

$ wget http://download.wikimedia.org/enwiki/latest/enwiki-latest-pages-articles.xml.bz2
$ bunzip2 enwiki-latest-pages-articles.xml.bz2 
$ python
>>> import xml.etree.ElementTree as ET
>>> tree = ET.parse('enwiki-latest-pages-articles.xml')
Killed

当我尝试使用标准 XML 解析器解析 xml 文件时,Python 出现错误。对于如何将 9GB 的 XML 文件转换为我可以加载到 mongoDB 中的 JSON-y 文件,有没有人有任何其他建议?

更新 1

按照下面 Sean 的建议,我也尝试了迭代元素树:

>>> import xml.etree.ElementTree as ET
>>> context = ET.iterparse('enwiki-latest-pages-articles.xml', events=("start", "end"))
>>> context = iter(context)
>>> event, root = context.next()
>>> for i in context[0:10]:
...     print(i)
... 
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
TypeError: '_IterParseIterator' object has no attribute '__getitem__'
>>> for event, elem in context[0:10]:
...     if event == "end" and elem.tag == "record":
...             print(elem)
...             root.clear()
... 
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
TypeError: '_IterParseIterator' object has no attribute '__getitem__'

同样,没有运气。

更新 2

跟进以下 Asya Kamsky 的建议。

这是尝试使用 xml2json:

$ git clone https://github.com/hay/xml2json.git
$ ./xml2json/xml2json.py -t xml2json -o enwiki-latest-pages-articles.json enwiki-latest-pages-articles.xml
Traceback (most recent call last):
  File "./xml2json/xml2json.py", line 199, in <module>
    main()
  File "./xml2json/xml2json.py", line 181, in main
    input = open(arguments[0]).read()
MemoryError

这是 xmlutils:

$ pip install xmlutils
$ xml2json --input "enwiki-latest-pages-articles.xml" --output "enwiki-latest-pages-articles.json"
xml2sql by Kailash Nadh (http://nadh.in)
    --help for help


Wrote to enwiki-latest-pages-articles.json

但内容只有一条记录。它没有迭代。

xmltodict,也看起来很有前途,因为它宣传使用迭代 Expat 并且对维基百科有好处。但它也在 20 分钟左右后耗尽了内存:

>>> import xmltodict
>>> f = open('enwiki-latest-pages-articles.xml')
>>> doc = xmltodict.parse(f)
Killed

更新 3

这是对 Ross 在下面的回答的回应,根据 link he mentions 对我的解析器进行建模:

from lxml import etree

file = 'enwiki-latest-pages-articles.xml'

def page_handler(page):
    try:
        print page.get('title','').encode('utf-8')
    except:
        print page
        print "error"

class page_handler(object):
    def __init__(self):
        self.text = []
    def start(self, tag, attrib):
        self.is_title = True if tag == 'title' else False
    def end(self, tag):
        pass
    def data(self, data):
        if self.is_title:
            self.text.append(data.encode('utf-8'))
    def close(self):
        return self.text

def fast_iter(context, func):
    for event, elem in context:
        print(elem)
        elem.clear()
        while elem.getprevious() is not None:
            del elem.getparent()[0]
    del context

process_element = etree.XMLParser(target = page_handler())

context = etree.iterparse( file, tag='item' )
fast_iter(context,process_element)

错误是:

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "<stdin>", line 2, in fast_iter
  File "iterparse.pxi", line 484, in lxml.etree.iterparse.__next__ (src/lxml/lxml.etree.c:112653)
  File "iterparse.pxi", line 537, in lxml.etree.iterparse._read_more_events (src/lxml/lxml.etree.c:113223)
  File "parser.pxi", line 596, in lxml.etree._raiseParseError (src/lxml/lxml.etree.c:83186)
lxml.etree.XMLSyntaxError: Extra content at the end of the document, line 22, column 1

最佳答案

您需要使用 iterparse 进行迭代而不是将整个文件加载到内存中。至于如何转换为 json 甚至转换为 python 对象以存储在数据库中 - 请参阅:https://github.com/knadh/xmlutils.py/blob/master/xmlutils/xml2json.py

更新

使用 iterparse 并保持低内存占用的示例:

试试 Liza Daly's fast_iter 的变体.在处理完一个元素 elem 后,它会调用 elem.clear() 来移除后代并移除之前的 sibling 。

from lxml import etree

def fast_iter(context, func):
    # http://www.ibm.com/developerworks/xml/library/x-hiperfparse/
    # Author: Liza Daly
    for event, elem in context:
        print(elem)
        elem.clear()
        while elem.getprevious() is not None:
            del elem.getparent()[0]
    del context

context = etree.iterparse( MYFILE, tag='item' )
fast_iter(context,process_element)

Daly 的文章非常值得一读,尤其是当您正在处理大型 XML 文件时。

关于python - 将(所有)维基百科数据加载到 mongodb 中?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/17286183/

有关python - 将(所有)维基百科数据加载到 mongodb 中?的更多相关文章

  1. python - 如何使用 Ruby 或 Python 创建一系列高音调和低音调的蜂鸣声? - 2

    关闭。这个问题是opinion-based.它目前不接受答案。想要改进这个问题?更新问题,以便editingthispost可以用事实和引用来回答它.关闭4年前。Improvethisquestion我想在固定时间创建一系列低音和高音调的哔哔声。例如:在150毫秒时发出高音调的蜂鸣声在151毫秒时发出低音调的蜂鸣声200毫秒时发出低音调的蜂鸣声250毫秒的高音调蜂鸣声有没有办法在Ruby或Python中做到这一点?我真的不在乎输出编码是什么(.wav、.mp3、.ogg等等),但我确实想创建一个输出文件。

  2. ruby - 如何以所有可能的方式将字符串拆分为长度最多为 3 的连续子字符串? - 2

    我试图获取一个长度在1到10之间的字符串,并输出将字符串分解为大小为1、2或3的连续子字符串的所有可能方式。例如:输入:123456将整数分割成单个字符,然后继续查找组合。该代码将返回以下所有数组。[1,2,3,4,5,6][12,3,4,5,6][1,23,4,5,6][1,2,34,5,6][1,2,3,45,6][1,2,3,4,56][12,34,5,6][12,3,45,6][12,3,4,56][1,23,45,6][1,2,34,56][1,23,4,56][12,34,56][123,4,5,6][1,234,5,6][1,2,345,6][1,2,3,456][123

  3. ruby - 解析 RDFa、微数据等的最佳方式是什么,使用统一的模式/词汇(例如 schema.org)存储和显示信息 - 2

    我主要使用Ruby来执行此操作,但到目前为止我的攻击计划如下:使用gemsrdf、rdf-rdfa和rdf-microdata或mida来解析给定任何URI的数据。我认为最好映射到像schema.org这样的统一模式,例如使用这个yaml文件,它试图描述数据词汇表和opengraph到schema.org之间的转换:#SchemaXtoschema.orgconversion#data-vocabularyDV:name:namestreet-address:streetAddressregion:addressRegionlocality:addressLocalityphoto:i

  4. ruby - 如何在续集中重新加载表模式? - 2

    鉴于我有以下迁移:Sequel.migrationdoupdoalter_table:usersdoadd_column:is_admin,:default=>falseend#SequelrunsaDESCRIBEtablestatement,whenthemodelisloaded.#Atthispoint,itdoesnotknowthatusershaveais_adminflag.#Soitfails.@user=User.find(:email=>"admin@fancy-startup.example")@user.is_admin=true@user.save!ende

  5. ruby-on-rails - 跳过状态机方法的所有验证 - 2

    当我的预订模型通过rake任务在状态机上转换时,我试图找出如何跳过对ActiveRecord对象的特定实例的验证。我想在reservation.close时跳过所有验证!叫做。希望调用reservation.close!(:validate=>false)之类的东西。仅供引用,我们正在使用https://github.com/pluginaweek/state_machine用于状态机。这是我的预订模型的示例。classReservation["requested","negotiating","approved"])}state_machine:initial=>'requested

  6. ruby - RuntimeError(自动加载常量 Apps 多线程时检测到循环依赖 - 2

    我收到这个错误:RuntimeError(自动加载常量Apps时检测到循环依赖当我使用多线程时。下面是我的代码。为什么会这样?我尝试多线程的原因是因为我正在编写一个HTML抓取应用程序。对Nokogiri::HTML(open())的调用是一个同步阻塞调用,需要1秒才能返回,我有100,000多个页面要访问,所以我试图运行多个线程来解决这个问题。有更好的方法吗?classToolsController0)app.website=array.join(',')putsapp.websiteelseapp.website="NONE"endapp.saveapps=Apps.order("

  7. ruby - Nokogiri 剥离所有属性 - 2

    我有这个html标记:我想得到这个:我如何使用Nokogiri做到这一点? 最佳答案 require'nokogiri'doc=Nokogiri::HTML('')您可以通过xpath删除所有属性:doc.xpath('//@*').remove或者,如果您需要做一些更复杂的事情,有时使用以下方法遍历所有元素会更容易:doc.traversedo|node|node.keys.eachdo|attribute|node.deleteattributeendend 关于ruby-Nokog

  8. ruby - Ruby 有 `Pair` 数据类型吗? - 2

    有时我需要处理键/值数据。我不喜欢使用数组,因为它们在大小上没有限制(很容易不小心添加超过2个项目,而且您最终需要稍后验证大小)。此外,0和1的索引变成了魔数(MagicNumber),并且在传达含义方面做得很差(“当我说0时,我的意思是head...”)。散列也不合适,因为可能会不小心添加额外的条目。我写了下面的类来解决这个问题:classPairattr_accessor:head,:taildefinitialize(h,t)@head,@tail=h,tendend它工作得很好并且解决了问题,但我很想知道:Ruby标准库是否已经带有这样一个类? 最佳

  9. ruby - 获取模块中定义的所有常量的值 - 2

    我想获取模块中定义的所有常量的值:moduleLettersA='apple'.freezeB='boy'.freezeendconstants给了我常量的名字:Letters.constants(false)#=>[:A,:B]如何获取它们的值的数组,即["apple","boy"]? 最佳答案 为了做到这一点,请使用mapLetters.constants(false).map&Letters.method(:const_get)这将返回["a","b"]第二种方式:Letters.constants(false).map{|c

  10. ruby-on-rails - 使用 config.threadsafe 时从 lib/加载模块/类的正确方法是什么!选项? - 2

    我一直致力于让我们的Rails2.3.8应用程序在JRuby下正确运行。一切正常,直到我启用config.threadsafe!以实现JRuby提供的并发性。这导致lib/中的模块和类不再自动加载。使用config.threadsafe!启用:$rubyscript/runner-eproduction'pSim::Sim200Provisioner'/Users/amchale/.rvm/gems/jruby-1.5.1@web-services/gems/activesupport-2.3.8/lib/active_support/dependencies.rb:105:in`co

随机推荐