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python - 绘制高维数据的决策边界

coder 2023-08-13 原文

我正在为二元分类问题构建一个模型，其中我的每个数据点都是 300 个维度(我使用了 300 个特征)。我正在使用 sklearn 的 PassiveAggressiveClassifier。该模型表现非常好。

我想绘制模型的决策边界。我该怎么做？

为了了解数据，我使用 TSNE 在 2D 中绘制它。我分两步减少了数据的维度——从 300 到 50，然后从 50 到 2(这是一个常见的建议)。下面是相同的代码片段:

from sklearn.manifold import TSNE
from sklearn.decomposition import TruncatedSVD

X_Train_reduced = TruncatedSVD(n_components=50, random_state=0).fit_transform(X_train)
X_Train_embedded = TSNE(n_components=2, perplexity=40, verbose=2).fit_transform(X_Train_reduced)

#some convert lists of lists to 2 dataframes (df_train_neg, df_train_pos) depending on the label - 

#plot the negative points and positive points
scatter(df_train_neg.val1, df_train_neg.val2, marker='o', c='red')
scatter(df_train_pos.val1, df_train_pos.val2, marker='x', c='green')

我得到了一个不错的图表。

有没有一种方法可以向该图添加一个决策边界，它代表我的模型在 300 暗空间中的实际决策边界？

最佳答案

一种方法是在您的 2D 图上施加 Voronoi 镶嵌，即根据与 2D 数据点的接近程度为其着色(每个预测类标签的颜色不同)。查看 Migut et al., 2015 最近发表的论文.

这比使用 meshgrid 和 scikit 的 KNeighborsClassifier 听起来容易得多(这是 Iris 数据集的端到端示例；用您的模型/代码替换前几行):

import numpy as np, matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.neighbors.classification import KNeighborsClassifier
from sklearn.datasets.base import load_iris
from sklearn.manifold.t_sne import TSNE
from sklearn.linear_model.logistic import LogisticRegression

# replace the below by your data and model
iris = load_iris()
X,y = iris.data, iris.target
X_Train_embedded = TSNE(n_components=2).fit_transform(X)
print X_Train_embedded.shape
model = LogisticRegression().fit(X,y)
y_predicted = model.predict(X)
# replace the above by your data and model

# create meshgrid
resolution = 100 # 100x100 background pixels
X2d_xmin, X2d_xmax = np.min(X_Train_embedded[:,0]), np.max(X_Train_embedded[:,0])
X2d_ymin, X2d_ymax = np.min(X_Train_embedded[:,1]), np.max(X_Train_embedded[:,1])
xx, yy = np.meshgrid(np.linspace(X2d_xmin, X2d_xmax, resolution), np.linspace(X2d_ymin, X2d_ymax, resolution))

# approximate Voronoi tesselation on resolution x resolution grid using 1-NN
background_model = KNeighborsClassifier(n_neighbors=1).fit(X_Train_embedded, y_predicted) 
voronoiBackground = background_model.predict(np.c_[xx.ravel(), yy.ravel()])
voronoiBackground = voronoiBackground.reshape((resolution, resolution))

#plot
plt.contourf(xx, yy, voronoiBackground)
plt.scatter(X_Train_embedded[:,0], X_Train_embedded[:,1], c=y)
plt.show()

请注意，这不会精确地绘制您的决策边界，而只会为您提供边界应该位于何处的粗略估计(尤其是在数据点很少的区域，真正的边界可能会偏离此)。它会在属于不同类的两个数据点之间画一条线，但会将它放在中间(在这种情况下确实保证在这些点之间有一个决策边界，但不一定非要在中间) .

还有一些实验方法可以更好地逼近真实的决策边界，例如this one on github

关于python - 绘制高维数据的决策边界，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/37718347/

高维pythonX_Train_embeddedembeddedTrainplotmachine-learningscikit-learndata-science

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