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单细胞测序之差异表达基因获得方法

1.加载数据library(Seurat)library(SeuratData)pbmcpbmcAnobjectofclassSeurat13714featuresacross2638sampleswithin1assayActiveassay:RNA(13714features,2000variablefeatures)2dimensionalreductionscalculated:pca,umap2.执行默认的差异表达测试Seurat的大部分差异表达特征可以通过“FindMarkers()”函数访问。默认情况下,Seurat基于非参数Wilcoxon秩和检验执行差分表达式。这取代了以前的